在人們還沒(méi)有察覺(jué)到的時(shí)候，未知的病毒——漏洞體，已經(jīng)在社會(huì)上蔓延開(kāi)來(lái)。政府在圣都大學(xué)附屬醫(yī)院秘密設(shè)立了電腦急救中心（CR），以應(yīng)對(duì)病毒蔓延的情況，避免人類(lèi)走向滅亡。在數(shù)字游戲的世界中，打敗游戲病毒漏洞體！使用與游戲企業(yè)共同研發(fā)出的玩家驅(qū)動(dòng)器【qì】與卡帶，候選人醫(yī)生就能變身為假面騎士！年輕的實(shí)習(xí)醫(yī)生寶生永夢(mèng)背負(fù)的命運(yùn)，就是變身為假面騎士艾克賽德，保護(hù)患者不受漏洞體侵害。