擁有28萬人口的三門市，其境內某天突然打開了一扇通往未知世界的大門。從大門的另一端，被稱為“近界民”的怪物蜂擁而出。人類驚慌失措之余發現，地球現有的武器對近界民完全沒有任何效果。危急時刻，神秘團體境界防衛組織“BORDER”出現擊退近界民，三門市總算回歸往昔的正常生活。如是過了四年半的時間，隱藏著作為“BORDER”成員身份的初中學生三云【yún】修（梶裕貴 配音）和轉學生空閑游真（村中知 配音）相遇，而對方竟然是來自門另一頭的近界民，此行的目的是為了找到自己的父親。分出不同陣營的二人，注定要在命運的戰爭中激烈碰撞……